Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA2O43364 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms