Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MCRIP1C9JLW8 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms