Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SHOC2Q9UQ13 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms