Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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USP18Q9UMW8 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USP18Q9UMW8 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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