Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SMG9Q9H0W8 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.3 ms