Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC010536.2-201ENST00000563036 338 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MIR4327-201ENST00000581194 85 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SL220P-201ENST00000581978 300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MIR6511A2-201ENST00000611011 67 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MIR6511A3-201ENST00000615389 67 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MIR6511A4-201ENST00000615860 67 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MIR6511A1-201ENST00000617664 67 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ATP5I-201ENST00000304312 365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC005005.1-201ENST00000397595 682 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TDGF1P4-201ENST00000401555 520 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL606490.3-201ENST00000422410 270 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CHCHD4P2-201ENST00000431135 420 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL135924.1-201ENST00000446146 423 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL121929.1-201ENST00000457120 524 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF780B-206ENST00000598845 401 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP000769.3-201ENST00000622944 536 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms