Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms