Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms