Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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CCDC85BQ15834 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CCDC85BQ15834 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CCDC85BQ15834 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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CCDC85BQ15834 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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