Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PDCD1Q15116 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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