Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SSPNQ14714 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms