Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ALCAMQ13740 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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