Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CUL4AQ13619 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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CUL4AQ13619 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CUL4AQ13619 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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