Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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