Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CHD3Q12873 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CHD3Q12873 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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