Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRGP23470 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms