Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP29Q9HBJ7 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP29Q9HBJ7 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP29Q9HBJ7 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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USP29Q9HBJ7 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
USP29Q9HBJ7 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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