Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
BBS9Q3SYG4 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms