Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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