Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NCOA4Q13772 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms