Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RUNX3Q13761 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms