Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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