Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NEUROD1Q13562 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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