Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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