Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
SGCGQ13326 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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