Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NME3Q13232 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
NME3Q13232 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
NME3Q13232 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms