Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FOXF1Q12946 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF1Q12946 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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