Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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