Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD3Q12873 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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