Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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BPTFQ12830 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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BPTFQ12830 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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