Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRGP23470 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRGP23470 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms