Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PTPREP23469 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPREP23469 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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PTPREP23469 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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