Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms