Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXQ1Q9C009 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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