Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms