Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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