Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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SGCAQ16586 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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SGCAQ16586 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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SGCAQ16586 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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SGCAQ16586 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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SGCAQ16586 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SGCAQ16586 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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