Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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