Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRRQ15256 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRRQ15256 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms