Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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