Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CNGB1Q14028 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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