Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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DDX39BQ13838 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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