Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CUL4BQ13620 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CUL4BQ13620 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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