Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EIF4EBP1Q13541 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms