Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PICALMQ13492 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PICALMQ13492 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms