Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TRIM28Q13263 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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