Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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FOXD4Q12950 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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FOXD4Q12950 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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FOXD4Q12950 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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FOXD4Q12950 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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FOXD4Q12950 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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