Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KCNH2Q12809 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms