Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
RBBP4Q09028 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms