Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EXOSC9Q06265 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms